Le CHEM est une fondation, gérée par un Conseil d' Administration constituée de quatre représentants de la Ville d’Esch-sur-Alzette, de quatre représentants de l’Arcelor-Mittal, de deux représentants de la Ville de Dudelange, d'un représentant respectif des villes de Pétange, Bascharage et Differdange et de deux représentants du Gouvernement. La Direction du CHEM est confiée à un Directeur Général assisté d’un Directeur Médical, des Soins, Administratif et Financier et d’un Directeur des Ressources humaines. Les activités cliniques sont réparties en Départements Cliniques soutenus par des services de support.